Het waterlab is een echt laboratorium, waar je met een witte labjas allerlei proefjes met water kunt doen. Zo kun je bijvoorbeeld een ei in water laten zweven of van zout zeewater zwembadwater maken. Het waterlab is geschikt voor kinderen van 6 tot en met 12 jaar. Het lab is geopend op zaterdag- en zondagmiddag van 12.30 tot 16.00 uur voor bezoekers van het watermuseum.

Op woensdag- en vrijdagmiddag wordt het lab gereserveerd voor kinderfeestjes. Gedurende de andere dagen van de week wordt het waterlab gebruikt voor schoolgroepen. Tijdens schoolvakanties worden er vaak speciale kinderactiviteiten georganiseerd in het waterlab, zoals haargel maken, het watermysterie of een sneeuwbol maken. Dan zijn er geen reguliere proefjes in het Waterlab.